Hòa ước Tôn giáo Augsburg bao gồm ba nguyên tắc chính: [3]

1. Nguyên tắc Cuius Regio, Eius Religio tạo sự thống nhất tôn giáo trong nội bộ một quốc gia: tôn giáo của công tước trở thành tôn giáo của nhà nước và tất cả cư dân của nó. Những cư dân không thể tuân thủ tôn giáo của công tước được phép chuyển đi nơi khác: một ý tưởng sáng tạo trong thế kỷ 16. Nguyên tắc này đã được thảo luận rất nhiều bởi các đại biểu khác nhau, cuối cùng đã đạt được thỏa thuận về các chi tiết cụ thể về từ ngữ được dùng sau khi kiểm tra vấn đề và giải pháp được đề xuất từ mọi góc độ có thể. [4]
2. Nguyên tắc thứ hai, được gọi là reservatum ecclesiasticum, bao gồm tình trạng đặc biệt của giáo hội một nước. Nếu vị giám mục của một giáo hội nhà nước thay đổi tôn giáo của mình, thì cư dân của nhà nước đó không phải làm như vậy. Thay vào đó, vị giám mục dự kiến sẽ từ chức khỏi vị trí của mình, mặc dù điều này không được viết ra trong thỏa thuận. [5]
3. Nguyên tắc thứ ba, được gọi là Declaratio Ferdinandei (Tuyên bố của Ferdinand), miễn trừ các hiệp sĩ và một số thành phố khỏi yêu cầu đồng nhất tôn giáo, nếu tôn giáo cải cách đã được thực hành ở đó từ giữa những năm 1520. Điều này cho phép một vài thành phố và thị trấn hỗn hợp nơi người Công giáo và Luther đã sống cùng nhau. Nó cũng bảo vệ thẩm quyền của các gia đình hoàng tử, các hiệp sĩ và một số thành phố để xác định sự đồng nhất tôn giáo có nghĩa là gì trong lãnh thổ của họ. Ferdinand đã chèn điều này vào phút cuối, dựa vào quyền của riêng mình. [6]

Nguyên tắc thứ ba đã miễn cho các hiệp sĩ và một số thành phố thuộc thẩm quyền của một công tước giáo phận nếu họ đã thực hành đạo Lutheran trong một thời gian (Lutheranism là nhánh duy nhất của đạo Tin lành được công nhận trong hòa ước). Điều khoản này không được công khai như một phần của hiệp ước, và được giữ bí mật trong gần hai thập kỷ. [7]